O NUBIO foi implantado em 2002 com o apoio da Reitoria, ANVISA, CNPq, FINEP e dos Ministérios da Educação e da Saúde, por iniciativa dos professores Dr Clóvis Ryuichi Nakaie e Dr Antônio de Miranda e da pesquisadora Dra Mineko Tominaga. Sua implatação ocorreu tendo em vista a demanda por centros bioanalíticos após a publicação da Lei dos Medicamentos Genéricos (Lei nº 9.787, de 10 de Fevereiro de 1999) e da Resolução-RDC nº 10, de 2 de Janeiro de 2001, que dispunha sobre as normas técnicas para a realização dos testes com os medicamentos, regulamentadas pela ANVISA.
Entrou em atividade a partir de 2003, após certificação da Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA), com a prestação de serviços para a Etapa Bioanalítica de Estudos de Bioequivalência para as Indústrias Farmacêuticas Públicas e Privadas.